Este circuito agrupa a la mayoría de los Institutos y Programas de investigación. También se encuentran instalaciones que originalmente estaban en el circuito escolar.
- Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, UNAM
- Instituto de Biología
- Instituto de Ciencias del mar y Limnología
- Instituto de Fisiología
- Instituto de Geofísica
- Instituto de Geografía
- Instituto de Ingeniería
- Museo de Zoología
- Centro de Ciencias de
- Centro de Información Científica y Humanística
- Centro para
- Coordinación de
- Facultad de Química (anexos: Edificio D,Conjunto E y Edificio F)
- Instituto de Astronomía
- Instituto de Biotecnología
- Instituto de Física
- Instituto de Geología
- Instituto de Matemáticas
- Instituto de Química
- Museo de Paleontología
- Programa Universitario de Alimentos
- Programa Universitario del Medio Ambiente
- Programa Universitario de Investigación en Salud
- Facultad de Ciencias
- Instituto de Ciencias Nucleares
- Instituto de Investigaciones en Materiales
